Ban Giám đốc và Hội đồng Quản lý Trung tâm gồm các chuyên gia có trình độ cao, giàu kinh nghiệm trong lĩnh vực y học, đào tạo và nghiên cứu khoa học. Tập thể lãnh đạo điều hành Trung tâm theo hướng chuyên nghiệp – minh bạch – hiệu quả, bảo đảm sự phát triển bền vững, chất lượng chuyên môn và uy tín của Trung tâm trong hệ thống y tế Việt Nam. Các thành viên Ban Giám đốc và Hội đồng Quản lý Trung tâm gồm:

• TS. BS. Trương Hồng Sơn – Giám đốc – Chủ tịch hội đồng quản lý Trung tâm, Phó Tổng thư ký Tổng hội Y học Việt Nam
• ThS. BS. Cao Thanh Hóa – Phó Giám đốc Trung tâm
• ThS. Lê Việt Anh – Phó Giám đốc Trung tâm
• PGS. TS. Lã Ngọc Quang – Ủy viên Hội đồng quản lý Trung tâm